circRNA是一种新的非编码RNA,具有共价连接的闭环结构,由反向剪接事件产生。目前已在许多植物物种中发现了大量潜在的circRNA,但对其在植物生物过程中的作用尚不十分清楚。论文在优化改进circRNA筛选方法的基础上,共鉴定出2616个与沙棘果实发育相关的circRNA,其中1721个(65.8%)来源于宿主基因的外显子,252个circRNA在沙棘果实3个不同发育时期差异表达。基于宿主基因功能注释,发现circRNA可能参与沙棘果实类胡萝卜素生物合成、脂质合成和植物激素信号转导。circRNA/miRNA/mRNA互作分析显示,53个circRNA富含miRNA结合位点,在细胞中对9个miRNA发挥海绵作用。通过设计circRNA背靠背特异引物(divergent primer)进行RT-qPCR和克隆测序,验证了6个circRNA的差异表达和反剪接位点。以上结果揭示了circRNA在沙棘果实成熟过程中具有重要的调控作用。
(林业所 相聪伟 段爱国)